Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms