Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms