Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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