Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms