Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Suds3Q8BR65 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Suds3Q8BR65 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms