Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem260Q8BMD6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem260Q8BMD6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms