Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms