Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Best2Q8BGM5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Best2Q8BGM5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms