Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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