Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms