Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfascQ810U3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms