Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZW0

Stk35, Serine/threonine-protein kinase 35, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk35Q80ZW0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stk35Q80ZW0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms