Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cldn34b3Q80ZS5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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