Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms