Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NischQ80TM9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NischQ80TM9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NischQ80TM9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NischQ80TM9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NischQ80TM9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NischQ80TM9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NischQ80TM9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NischQ80TM9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NischQ80TM9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NischQ80TM9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NischQ80TM9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NischQ80TM9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NischQ80TM9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NischQ80TM9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NischQ80TM9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NischQ80TM9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NischQ80TM9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NischQ80TM9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NischQ80TM9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
NischQ80TM9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NischQ80TM9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
NischQ80TM9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NischQ80TM9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NischQ80TM9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NischQ80TM9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NischQ80TM9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NischQ80TM9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NischQ80TM9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NischQ80TM9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NischQ80TM9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NischQ80TM9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NischQ80TM9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NischQ80TM9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NischQ80TM9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
NischQ80TM9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NischQ80TM9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
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