Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms