Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms