Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms