Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms