Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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