Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Cnih3Q6ZWS4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cnih3Q6ZWS4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cnih3Q6ZWS4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cnih3Q6ZWS4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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