Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot1Q6ZQ08 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms