Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ino80Q6ZPV2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms