Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc44a1Q6X893 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms