Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms