Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx4Q6RUU0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms