Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms