Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

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Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RimklaQ6PFX8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RimklaQ6PFX8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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