Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms