Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb39Q6PDK0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbtb39Q6PDK0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms