Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms