Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms