Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc4Q6P2L7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms