Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms