Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic1Q6NXK8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms