Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms