Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SphkapQ6NSW3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SphkapQ6NSW3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SphkapQ6NSW3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SphkapQ6NSW3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SphkapQ6NSW3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SphkapQ6NSW3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SphkapQ6NSW3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SphkapQ6NSW3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SphkapQ6NSW3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SphkapQ6NSW3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms