Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms