Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Tpm4Q6IRU2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Tpm4Q6IRU2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Tpm4Q6IRU2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Tpm4Q6IRU2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms