Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms