Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt40Q6IFX3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms