Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms