Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
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Cep290Q6A078 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Cep290Q6A078 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cep290Q6A078 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cep290Q6A078 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cep290Q6A078 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cep290Q6A078 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cep290Q6A078 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cep290Q6A078 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cep290Q6A078 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cep290Q6A078 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cep290Q6A078 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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