Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sv2cQ69ZS6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms