Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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