Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk13Q69ZA1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms