Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spty2d1Q68FG3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms