Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms