Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifit1Q64282 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifit1Q64282 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms