Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ScxQ64124 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms